「大量のヒューマギアが心無き存在に悪用され、人類を襲う」 飛電インテリジェンスが開発したAIロボ、ヒューマギア。 様々な仕事の現場で従順に働く彼らがやがて暴走する…!? 飛電是之助の遺言は、人類が脅威するシンギュラリティなのか？ 君の仕事は人類滅亡だよ。 滅亡迅雷.netの滅、迅は、 ゼツメライザーとゼツメライズキーでヒューマギアに悪の魂を吹き込む。 私の仕事は、人間を…滅亡させること。 マギアと化すヒューマギアに密かに国家機関も対抗。 特務機関A.I.M.S.（エイムズ）の諫と唯阿は暴走するヒューマギア＝マギアと戦う！ ヒューマギアは殺人マシン、残らずぶっ潰す！ 対抗手段はただ一つ。ゼロワンドライバーとプログライズキー。 使用権限があるのは、飛電インテリジェンスの新社長、飛電或人のみ。 変身！ 或人は、仮面ライダーゼロワンとして戦う。 人々の夢と希望を守るため、ヒューマギアの可能性を証明するため。 「お前を倒すのはただ一人、オレだ！」 戦いの先にある未来、それはAIとの平和的な共存か、人類の滅亡か!?