| 順位 | 大学名 | 合計タイム |
|---|---|---|
| 1位 | 北海道教育大学 （13年ぶり3回目） |
5時間38分35秒 |
| ▲ 選考通過 ▲ | ||
| 2位 | 札幌学院大学 | 5時間42分38秒 |
| 3位 | 北海道大学 | 5時間44分17秒 |
| 4位 | 道都大学 | 5時間55分14秒 |
| 5位 | 北海学園大学 | 6時間03分19秒 |
| 6位 | 帯広畜産大学 | 6時間35分55秒 |
| 7位 | 北星学園大学 | 6時間55分03秒 |
| 8位 | 小樽商科大学 | 測定不能 |
| 開催日 |
開会式：2016年8月19日（金） 競技スタート：2016年8月20日（土） |
| 大会名 | 北海道知事杯第28回北海道大学駅伝対校選手権大会 兼 秩父宮賜杯 第48回全日本大学駅伝対校選手権大会 北海道地区選考会 |
| 会場 | モエレ沼公園（札幌市） |
| 備考 | 1校を決定 |
| 全日本大学選抜チーム | |
| 滋野 聖也 | 道都大学 |
| 原 由幸 | 道都大学 |